Лазарь Меклер “Я ПОСТРОИЛ МОДЕЛЬ БЕЛКА”

Лазарь Меклер “Я ПОСТРОИЛ МОДЕЛЬ БЕЛКА”

Открытое письмо доктору Масахиро Ивакура и всем, интересующимся проблемой формирования трехмерных молекул биополимеров (фолдингом), ее научным и коммерческим аспектом.

Копия: доктору Джону Мэддоксу.

Вторая копия: профессору Стэнли Б. Прусинеру.

Я, доктор биологических наук, лидер лаборатории теоретического естествознания фирмы "Biocode Ltd" (Тель-Авив, Израиль), прочел Вашу статью, опубликованную в "Nature Structural Biology", VII, с. 580 ("Systematic Circular Permutation Of An Entire Protein Reveals Essential Folding Elements").

Я увидел и убедился в том, что Вы ближе всех иных исследователей подошли к решению проблемы фолдинга белков, которую я решил уже давным-давно. В основе найденного мной решения лежит открытый мной еще в 1969 году Общий Стереохимический Генетический Код (ОСГК), состоящий из 6 частных кодов, и теория фолдинга, функционирования и эволюции биополимеров, согласно этому коду.

I частный код — это всем хорошо известные правила Чаргаффа-Уотсона-Крика, определющие построения трехмерных молекул биологических полинуклеотидов; II частный код — известный генетический код; III частный код детерминирует фолдинг биополипептидов по ходу их биосинтеза в клетках; IV частный код детерминирует преобразование промежуточных (возбужденных) трехмерных молекул, построенных согласно третьему частному коду, что означает переход этих молекул из возбужденного в основное состояние, известное всем как нативное, устанавливаемое при помощи РСА или ЯМР анализов; V частный код детерминирует узнавание ДНК и РНК, кодирующих данный биологический полипептид и находящихся в возбужденном (крестообразном) состоянии, соответствующими биополипептидами, также находящимися в возбужденном состоянии; VI частный код детерминирует переход этих комплексов, находящихся в возбужденном состоянии, в конечное основное, нативное состояние.

Кратко основы этой теории изложены в журнале "Природа", издание РАН РФ №5, 1993 год, сс.28-70. В ней доказано, что ключ к центральной проблеме современной биологии — проблеме формирования трехмерных молекул белков — стереохимическая комплементарность аминокислотных остатков, кодируемых кодоном и антикодоном соответственно — один из шести частных кодов ОСГК. Разработана теория самоорганизации и функционирования трехмерных молекул пептидов, полипептидов и белков, согласно ОСГК. Ее применение иллюстрируется примерами построения моделей "промежуточных" (возбужденных) и "нативных" (основных) молекул тахиплезина, полипептида SH3 и репрессора cro фага l, полностью соответствующих результатам их физико-химического анализа, ЯМР-спектроскопиии и РСА. Демонстрируются возможности проектирования пептидных вакцин и разнообразных лекарств, исходя из данной теории.

Заявку на патент, согласно этому фолдингу, я подал в Израиле 27 января 1997 года, №120077. Однако в этой заявке изложена реализация только 1-й стадии процесса: формирования промежуточных структур биополипептидов по ходу их биосинтеза в клетках. Эта стадия реализуется согласно III частному коду ОСГК, о чем подробно рассказывается в упомянутой выше статье.

Вторая стадия этого процесса, которая пока не запатентована, — тоже ключевая. Она реализуется согласно IV частному коду ОСГК. В результате ее реализации модель трехмерной промежуточной возбужденной структуры данного биополипептида превращается в точную копию модели, которую получают в результате РСА или ЯМР-анализа.

Мое авторство в открытии III частного кода признано американцами. Например, в статье И. Чайкен, опубликованной в "PNAS USA" в 1990-м году; в статье Р. С. Рут-Бернштейна, опубликованной в "Journal Of Theoretical Biology" в 90-х годах; в патенте Е. Блалок на использование открытого мною III частного кода и открытого им в 1984 году, однако без ссылки на меня (в последующих патентах он меня цитирует).

Верность разработанной мной упомянутой выше теории фолдинга я подтвердил в пяти независимых слепых тестах:

— в Москве перед Комиссией АН СССР, о чем рассказано в упомянутом выше журнале "Природа";

— в Лаборатории структурной биологии Института Вейцмана (Реховот), где тест проводили временные сотрудники этого института Лидия Масюк и Евгений (?), составившие имеющиеся письменные протоколы этих слепых тестов;

— в Иерусалимском университете слепое тестирование проводил проф. А. Гольдблюм (тел.: 972-2-5758701 (?)) в присутствии бывшего посла Израиля в России г-на Арье Левина (дом. тел.: 972-2-5634473);

— профессором Отдела биологии клеток Тель-авивского университета Дж. Гершони (тел.: 972-3-6409011);

— в Первом международном конкурсе по фолдингу (США), который проводили профессора Дж. Маулд и Ф. Коэн. Однако эти ученые сознательно исказили представленный мной результат, засчитав мне модели промежуточных молекул данных полипептидов вместо конечных нативных рентгеновских, которые я посылал им также, ибо по условиям конкурса я обязан был рассказать, каким образом я получаю конкурсную построенную мной нативную модель. Я думаю, что причина такого их поведения кроется в том, что, одновременно построив такие модели прайонов, я сообщил об этом шефу Коэна, профессору Стэнли Прусинеру, чем стал, по-видимому, нежелательным конкурентом для Коэна. Поняв это обстоятельство, я через их голову, хотя это запрещалось условиями конкурса, послал представленные им модели также профессору Бусьеру (университет Сев. Каролины), автору РСА одного из этих белков (RTR). К упомянтутым выше моделям я добавил также модель димеро-RTR, которую я построил вне конкурсного задания, зная, что, согласно разработанной мной теории, этот белок обязательно образует димер. В ответ проф. Бусьер направил мне письмо, в котором особо подчеркнул, что верны не только конкурсные модели, но и модель димера, поздравив меня с полным успехом. После всего этого, убедившись в нечестности организаторов этого конкурса, я в дальнейшем перестал в них участвовать.

В данное время, в качестве очередного внутреннего экзамена для себя, я построил модель белка, опубликованную на обложке только что полученного мною журнала "Proteins", т.40, №1, 2000 год. Я построил, как всегда, сначала модель промежуточной молекулы этого белка, а затем преобразовал эту модель в модель нативного белка. Затем, обнаружив удивительную тождественность обоих трехмерных молекул, я, стараясь проверить неслучайность этих результатов, в качестве дополнения построил модели промежуточных и конечных молекул трех его гомологов: Ef (28% гомологии), Ec (48% гомологии), St (46% гомологии), — и убедился в полной структурной тождественности всех 4-х молекул!

Я обращаюсь к Вам, находясь в исключительных обстоятельствах. Я попал в руки моих компаньонов по фирме, упомянутых выше, — агрессивных дельцов, которые, угрожая выкинуть меня на улицу, заставляют передать им все права на мое открытие.

Я по образованию физикохимик, окончил с отличием Химический факультет МГУ им. М. В. Ломоносова в 1962 году. В 1969 году защитил одновременно на одном заседании Ученого совета Института биофизики АН СССР в Пущино кандидатскую и докторскую диссертации на тему "Свойства поверхностей вирусов и клеток. Некоторые вопросы теории и методы экспериментального решения проблемы." Открытый мной ОСГК — одна из глав этой диссертации. Я автор более 150 научных публикаций, из них более 40 опубликованы за рубежом в ведущих научных журналах. Семь из этих публикаций (3 теоретических articles и 4 экспериментальных letters) помещены в журнале "Nature" (Лондон).

Я готов открыть Вам всем все, что я знаю, и готов поделиться с Вами всеми всем, что я умею. Я покажу Вам, как, исходя из ленты, изготовленной из плоской бумаги, разграфленной на квадратики, имитирующей аминокислотную последовательность данного биологического полипептида длиной до трехсот с лишним его аминокислотных остатков, согласно III частному коду ОСГК, я строю вручную модель промежуточной молекулы данного белка всего за 1-3 рабочих дня; а затем в очередные 2-3 дня, согласно IV частному коду ОСГК, преобразую эту модель в модель нативной молекулы данного биополимера, — и все это вручную, вовсе не прибегая к компьютеру!

Я обращаюсь к Вам с настоятельной просьбой: сообщить о моем местонахождении (Тель-Авив, Рамат-Авив, 69499, Кашани стрит, дом 3, квартира 27, 7 этаж, Лаборатория теоретического естествознания фирмы "Biocode Ltd", тел.: 972-3-642-76-99 и мой домашний телефон: 972-3-642-25-72) научному атташе посольства Японии в Израиле, чтобы он незамедлительно посетил меня. Я покажу ему на месте все, о чем я написал Вам выше, — правду, ничего, кроме правды, но далеко не всю правду, ибо вся правда — на несколько порядков выше того, что я написал.

По сути дела, у меня в руках истинное решение проекта "Геном человека", содержащее все детали, касающиеся его прикладных аспектов, как то:

— проектирование вакцин-пептидов;

— проектирование лекарств строго прицельного действия;

— одноступенчатая очистка биополимеров до степени удаления примесей, исключающая узнавание остаточных примесей иммунологической системы организма;

— проектирование (исходя из мезофильных белков) термостабильных их вариантов, полностью функционирующих при температурах выше 100 градусов, и многое другое.

Мною подготовлены соответствующие патентные заявки по всем этим темам. Всем этим я хочу поделиться с Человечеством.

Конечно, само собой разумеется, что я готов ответить на все Ваши вопросы, если Вы позвоните мне по телефону: 972-3-642-76-99. Единственным затруднением является тот факт, что хотя я перевел с английского на русский десять книг по физике, химии, вирусологии, цитологии, микробиологии, иммунологии и практическое руководство по молекулярной биологии и вирусологии, я, к сожалению, понимаю английский язык только глазами, а не ушами. Поэтому необходим англо-русский переводчик.

В надежде на Ваш отклик, искренне Ваш, Лазарь Борисович Меклер, доктор биологических наук, 20 июля 2000 года.

P.S. К моменту перевода этого письма на английский я построил модели и промежуточной и нативной формы белка, с которым Вы работали в данном случае. При этом я полностью опишу техники преобразования и тем самым докажу, что все нативные молекулы биополимеров действительно строятся природой, согласно IV частному коду ОСГК.

P.P.S. (проф. Прусинеру) Только вчера получил очередной номер "PNAS USA", том 97, №11, 2000 год, посвященный разработке Вами антипрайонных лекарств. Имея в виду, что, согласно разработанной мною теории, биологические функции (подобно химическим) реализуются только макромолекулами (молекулами), находящимися в возбужденном состоянии, переходящими в основное состояние по завершении данной функции, только использование построенной мной модели возбужденных и основных макромолекул прайонов (о чем я сообщал Вам несколько лет тому назад) позволяет проектировать антипрайонные лекарства на строго рациональной, а не эмпирической основе.

Я готов спроектировать для Вас соответствующие препараты-пептиды. Конечно, я понимаю, что сначала Вы должны увидеть мои модели прайонов. К сожалению, я могу показать их Вам только в Тель-Авиве, в Лаборатории теоретического естествознания по указанному выше адресу. Но немедленно. Ибо очень вероятно, что мои инвесторы выполнят свои угрозы, о которых идет речь в данном письме.

Само собой разумеется, что я готов ответить на все Ваши вопросы, если Вы того пожелаете, по тел.: 972-3-642-76-99, при наличии англо-русского переводчика.

В надежде на Ваш быстрый ответ, искренне Ваш

Лазарь Меклер

22 июля 2000 года.

Предлагаем Вашему вниманию модель Lada Калина 9 седан 1.4 16-кл - это одна из наиболее популярных моделей.